Una vez una patente sea concedida por la Oficina Europea de Patentes, el solicitante podrá solicitar que tenga efectos unitarios en los países participantes, en el plazo de un mes desde la publicación de la mención de la concesión en el Boletín Oficial Europeo de Patentes. Es importante recordar, por la confusión que suele haber al respecto, que cualquier solicitante independientemente de que pertenezca a un Estado participante en la cooperación reforzada o no, podrá solicitar una patente europea con efectos unitarios. Es decir, cualquier solicitante español podrá solicitar una patente europea con efectos unitarios, aunque ésta no tendrá efectos en España. Si se desea que la patente europea tenga efectos en España y en otros países no participantes como por ejemplo Suiza, Noruega o Turquía, deberá validarla en esos Estados, lo que normalmente implica la presentación de una traducción y el pago de una tasa de validación así como el pago de las anualidades posteriores a la fecha de concesión.
Para que la patente unitaria, que es una patente europea con efectos unitarios según el art. 142 del Convenio de la Patente Europea (ya existe un acuerdo de ese tipo que permite obtener una patente europea con efectos únicos en Suiza y Liechtenstein) pueda solicitarse es necesario un tribunal único (el UPC – Unified Patent Court), el cual es el objeto de un acuerdo firmado en febrero de 2013 por todos los Estados participantes en la cooperación reforzada excepto Polonia y al que también se sumó Italia. El UPC actuará como Tribunal para todas las patentes concedidas por la Oficina Europea de Patentes, no únicamente las de efecto unitario y tendrá su principal sede en París con subsedes en Londres y Múnich, pudiendo existir divisiones locales y regionales. Para que el UPC pueda comenzar a funcionar y por tanto se puedan conceder patentes con efecto unitario es necesario que el acuerdo sea ratificado por 13 Estados, entre los que deberán estar Francia, Alemania y Reino Unido. De momento lo han ratificado Francia, Suecia, Bélgica, Austria y Dinamarca (en este último caso tras un referéndum que coincidió con las últimas elecciones europeas). Probablemente Irlanda también deberá someter la ratificación a referéndum.
Situación actual y posible fecha de inicio
Actualmente existe cierta incertidumbre respecto a cuándo se pondrá en marcha la patente unitaria. Personas directamente involucradas en el proceso han afirmado que la patente unitaria se podrá solicitar a finales del 2015 o principios de 2016. Parece haber cierto consenso en que no será posible solicitarla antes de la primavera de 2016.